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一种肺炎克雷伯菌耐药性检测方法、系统、设备及介质
本发明涉及计算机信息处理技术领域,尤其涉及一种肺炎克雷伯菌耐药性检测方法、系统、设备及介质,其方法包括:获取并处理待测菌株的原始质谱数据,从中确定拓扑持久度以筛选特征峰,构建有序特征序列;利用数据增强生成视图对,并映射为位置编码与强度嵌入张...
基于概率框架和广义主成分分析原理的空间多组学分析方法
本发明公开一种基于概率框架和广义主成分分析原理的空间多组学分析方法,针对空间多组学数据高维度、模态异质性、空间复杂性的核心挑战,实现多模态数据高效整合与精准空间解析。数据预处理完成特征筛选、归一化,并将数据转换为矩阵格式;模型训练中为每个潜...
基于高斯过程隐变量模型的单细胞多组学降维方法
本发明公开一种基于高斯过程隐变量模型的单细胞多组学降维方法,旨在解决现有技术难以兼顾单组学与多组学数据分析需求,且无法有效应对单细胞数据高稀疏性与技术噪声的问题。本发明通过构建共享潜在空间概率生成框架,结合变分推断与稀疏高斯回归策略,将不同...
一种基于密度感知簇结构引导对比学习的多组学癌症亚型识别方法、系统、设备及介质
一种基于密度感知簇结构引导对比学习的多组学癌症亚型识别方法、系统、设备及介质,属于生物信息学与人工智能交叉技术领域。该方法包括如下步骤:多组学数据获取与预处理;构建组学特异自编码器并学习潜在表示;在潜在空间中构建密度感知簇块;基于簇块样本重...
一种基于大语言模型与多模态数据的复杂性状基因挖掘方法及系统
本申请提供了一种基于大语言模型与多模态数据的复杂性状基因挖掘方法及系统,属于基因数据分析技术领域,该方法包括:获取包含不同豆类群体的多模态数据的统计数据集;基于参考基因组对统计数据集中的所有基因进行注释,得到全基因组语义图谱;若大语言模型接...
一种基于空间约束与对抗学习的空间多组学数据预测方法、模型及应用
本公开是一种基于空间约束与对抗学习的空间多组学数据预测方法、模型及应用,该预测方法包括:模态特异编码与潜在变量推断;基于稀疏变分高斯过程的空间依赖性建模;空间依赖约束的潜在变量建模;基于对抗学习的多模态潜在表示对齐;模态特异解码与跨模态特征...
基于机器学习对神经胶质瘤的预后基因特征的分析方法
本发明涉及生物检测领域,公开了一种基于机器学习对神经胶质瘤的预后基因特征的分析方法包括:获取神经胶质瘤评估样本对应的预后基因表达数据以及病理变量数据;基于预构建的预后评分模型确定预后基因表达数据的预后基因评分;根据预后基因评分以及病理变量数...
环境样品中耐药致病菌的基因组识别、定量与可视化方法
本发明提出一种环境样品中耐药致病菌的基因组识别、定量及可视化方法,适用于各类环境中风险性耐药致病菌的鉴别。该方法(1)基于宏基因组测序大数据集,利用基因组质控、组装与分箱技术,获得高质量细菌基因组;(2)识别其中携带抗生素耐药基因的耐药菌基...
一种基于语义一致性超图对比学习的生物分子关系建模方法
本发明公开了一种基于语义一致性超图对比学习的生物分子关系建模方法,旨在通过有效地结合局部结构和全局语义信息来建模生物分子之间的复杂关系。该方法首先通过扩展子图引导的消息聚合机制,丰富节点的局部表示,并结合全局上下文信息以提高生物分子关系的建...
一种基于层次因果建模的跨组学稀疏特征选择系统及方法
本发明提供一种基于层次因果建模的跨组学稀疏特征选择系统及方法,包括数据输入与预处理模块,用于接收多元样本的多组学原始数据;层次因果结构学习模块,与所述数据输入与自适应预处理模块连接,用于构建跨组学的层级因果拓扑;因果导向稀疏特征选择模块,与...
一种门控与交互路由的混合专家lncRNA–蛋白质互作预测方法
本发明提出了一种门控与交互路由的混合专家lncRNA–蛋白质互作预测方法,涉及生物大数据分析与深度学习交叉应用领域。该方法融合蛋白质互作网络信息、lncRNA与蛋白质序列信息,以及由序列提取的二级结构与理化性质特征构建多模态表示;在统一训练...
一种生物多样性动态监测方法
本发明提供了一种生物多样性动态监测方法,涉及生态环境遥感监测技术领域,方法包括:首先基于遥感生物多样性关键变量框架获取核心指标,并引入土壤及情境变量;接着构建模组可靠性门控以评估各指标模组的可信度;利用情境变量引导构建情境自适应表征模型,通...
一种基于靶向纳米孔测序数据的生殖道微生物和耐药基因分析方法
本发明公开了一种基于靶向纳米孔测序数据的生殖道微生物和耐药基因分析方法,包括:构建微生物参考数据库,获得样本的靶向纳米孔测序的原始测序数据;对原始测序数据进行质控,获得高质量的有效序列集;通过引物比对后进行靶向序列鉴定,提取靶向序列;用提取...
基于MCP蛋白靶点的抗罗氏沼虾虹彩病毒天然化合物的筛选方法
本申请涉及材料科学与工程领域,具体公开了基于MCP蛋白靶点的抗罗氏沼虾虹彩病毒天然化合物的筛选方法。该方法包括:构建病毒主衣壳蛋白MCP的三维结构并确定活性口袋;对天然化合物库进行结构预处理;以所述活性口袋为靶点,通过分子对接进行多轮虚拟筛...
面向宏基因组组装基因组的革兰氏属性识别方法及终端
本发明公开了一种面向宏基因组组装基因组的革兰氏属性识别方法、计算机可读存储介质及终端。识别方法包括:构建并筛选组装基因组,提取经基因组总长度归一化的组成特征和经基因总数归一化的功能特征;通过并行映射模块将两类特征映射至同一维度空间,得到组成...
一种抗原预测方法及装置
本发明涉及抗原预测技术领域,公开了一种抗原预测方法,包括以下步骤:步骤1:收集已知病毒蛋白的HA序列和HI数据;步骤2:对HA序列和HI数据进行数据预处理,分别得到原始相似度矩阵和原始抗原距离矩阵;步骤3:基于极大选择原理进行自适应傅里叶分...
一种基于深度学习的胶原蛋白熔解温度预测方法
本发明公开了一种基于深度学习的胶原蛋白熔解温度预测方法,包括:根据动态掩码处理后的胶原蛋白序列,结合氨基酸种类进行多维编码,根据动态掩码进行序列处理,得到多维特征张量;根据多维特征张量,依次通过两层卷积层进行特征映射;进而根据动态掩码,对卷...
基于转录组多重比对数据的融合转录本识别方法、装置、系统及介质
本申请提供基于转录组多重比对数据的融合转录本识别方法、装置、系统及介质,其核心在于构建了一套面向多重映射读段的全链条分析框架,来实现融合基因检测。包括:基于宽松映射策略的配对读段初筛模块、基于外显子图结构的候选融合构建模块、基于增强参考转录...
基于聚类与图构建对三代测序数据进行组装的方法、系统、设备和介质
本申请公开了一种基于聚类与图构建对三代测序数据进行组装的方法、系统、设备和介质,属于生物序列处理技术领域。本申请的方法包括以下步骤:基于所述三代测序数据获得序列相似度,利用聚类算法将序列进行聚类,得到不同的簇;对同一簇内的序列基于图构建的方...
一种基线建模的方法、MSI状态检测的方法及存储介质
本申请涉及一种基线建模的方法、MSI状态检测的方法及存储介质,本申请通过选取基线样本以及目标MSI位点,对基线样本进行二代测序,得到测序序列;根据唯一分子标签对所述测序序列进行分组,对每组内的测序序列进行碱基矫正,筛选出各组位点的最优序列;...
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