深圳湾实验室孙坤获国家专利权
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龙图腾网获悉深圳湾实验室申请的专利一种肿瘤恶性程度评估方法、电子设备和存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116312789B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-05-08发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310370089.X,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权一种肿瘤恶性程度评估方法、电子设备和存储介质是由孙坤;胡丁雪;刘晓懿设计研发完成,并于2023-03-31向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种肿瘤恶性程度评估方法、电子设备和存储介质在说明书摘要公布了:本申请公开了一种肿瘤恶性程度评估方法、电子设备和存储介质,一种肿瘤恶性程度评估方法包括:将待测肿瘤样本输入到综合危险比指数模型,综合危险比指数模型根据待测肿瘤样本输出综合危险比指数,根据综合危险比指数判断待测肿瘤样本的恶性程度,仅需获得患者的待测肿瘤的转录组数据即可评估待测肿瘤的恶性程度,方式简单,费用低,耗时短,综合危险比指数模型能根据待测肿瘤分子层面信息得到综合危险比指数,实现肿瘤恶性程度定量分析,能精准评估各个时期的肿瘤患者生存情况。
本发明授权一种肿瘤恶性程度评估方法、电子设备和存储介质在权利要求书中公布了:1.一种处理器可执行的肿瘤恶性程度评估程序,其特征在于,其被处理器执行时实现的肿瘤恶性程度评估方法包括: 将待测肿瘤样本输入到综合危险比指数模型,所述待测肿瘤样本包括待测肿瘤的转录组数据; 所述综合危险比指数模型根据所述待测肿瘤样本输出综合危险比指数; 根据所述综合危险比指数判断所述待测肿瘤样本的恶性程度; 所述综合危险比指数模型通过以下方法构建: 获取多个肿瘤样本数据和与所述肿瘤样本数据对应的癌旁样本数据,所述肿瘤样本数据包括第一转录组数据和患者预后信息,所述第一转录组数据为肿瘤样本的转录组数据,所述癌旁样本数据包括第二转录组数据,所述第二转录组数据为癌旁样本的转录组数据; 根据所述第一转录组数据和所述第二转录组数据筛选出差异表达基因; 将所述肿瘤样本数据分为训练集和测试集; 获取所述差异表达基因在所述训练集中的表达量; 根据所述差异表达基因在所述训练集中的表达量将所述训练集分为高表达量组和低表达量组; 对所述高表达量组和所述低表达量组进行生存分析,得到与所述差异表达基因对应的P值和HR值,所述P值为犯错概率; 根据所述P值从所述训练集中筛选出候选基因,所述候选基因为与患者的预后相关的所述差异表达基因; 根据所述P值从小到大对每个类型的所述候选基因进行排序得到显著性序列; 选取每个类型的所述显著性序列中前40个所述候选基因为预后相关基因;所述预后相关基因为与患者的预后相关的所述差异表达基因,所述预后相关基因的类型包括疑似原癌基因、疑似上调保护基因、疑似肿瘤抑制基因和疑似下调保护基因,所述疑似原癌基因为在所述肿瘤样本数据中上调表达且导致更差预后的所述差异表达基因,所述疑似上调保护基因为在所述肿瘤样本数据中上调表达且导致更好预后的所述差异表达基因,所述疑似肿瘤抑制基因为在所述肿瘤样本数据中下调表达且导致更差预后的所述差异表达基因,所述疑似下调保护基因为在所述肿瘤样本数据中下调表达且导致更好预后的所述差异表达基因; 根据所述预后相关基因构建综合危险比指数模型;所述综合危险比指数的计算公式为: 其中,为综合危险比指数,为第个所述预后相关基因对应的所述HR值,为第个所述预后相关基因对应的计算系数,所述计算系数的获取方法为:获取每个所述预后相关基因在所有所述肿瘤样本数据中的表达量;根据每个所述预后相关基因在所有所述肿瘤样本数据中的表达量确定阈值,所述阈值为所述表达量的中位数;获取所述预后相关基因在所述待测肿瘤样本中的表达量;根据所述阈值、所述预后相关基因的类型和所述预后相关基因在所述待测肿瘤样本中的表达量确定所述计算系数,若所述预后相关基因为所述疑似原癌基因或所述疑似下调保护基因,且所述预后相关基因在所述待测肿瘤样本中的表达量高于所述阈值,则所述计算系数为1;若所述预后相关基因为所述疑似原癌基因或所述疑似下调保护基因,且所述预后相关基因在所述待测肿瘤样本中的表达量低于所述阈值,则所述计算系数为-1;若所述预后相关基因为所述疑似上调保护基因或所述疑似肿瘤抑制基因,且所述预后相关基因在所述待测肿瘤样本中的表达量高于所述阈值,则所述计算系数为-1;若所述预后相关基因为所述疑似上调保护基因或所述疑似肿瘤抑制基因,且所述预后相关基因在所述待测肿瘤样本中的表达量低于所述阈值,则所述计算系数为1; 通过所述测试集对所述综合危险比指数模型进行验证。
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