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武汉大学殷雷获国家专利权

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龙图腾网获悉武汉大学申请的专利一种Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测的方法和系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116153403B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-05-08发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211560928.6,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权一种Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测的方法和系统是由殷雷;刘世奇;刘欢;周进设计研发完成,并于2022-12-07向国家知识产权局提交的专利申请。

一种Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测的方法和系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测的方法和系统,所述方法包括:获得Lb2Cas12a蛋白突变体的氨基酸序列以及相对应的酶活的原始数据;使用编号为KARS160105的AAindex索引来对氨基酸序列进行数字化编码,获得数字化的氨基酸序列;将所述数字化的氨基酸序列进行处理,获得由数字化的氨基酸序列的均值和突变的位置的数字组成的原始数据集,并随机分为训练集、验证集和测试集;利用训练集内的数据进行训练,获得初步的模型;利用验证集内的数据对初步的模型进行调整,获得最好的模型后在测试集上测试模型的泛化性;利用构建好的模型对所有Lb2Cas12a蛋白的单突变体进行逐条处理,获得Lb2Cas12a蛋白突变体活性的预测结果。该方法操作便捷。

本发明授权一种Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测的方法和系统在权利要求书中公布了:1.一种Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测的方法,其特征在于,所述方法包括: 获得Lb2Cas12a蛋白突变体的氨基酸序列以及相对应的酶活的原始数据; 使用编号为KARS160105的AAindex索引来对氨基酸序列进行数字化编码,获得数字化的氨基酸序列; 将所述数字化的氨基酸序列进行处理,获得由第一特征值和第二特征值组成的原始数据集,并将所述原始数据集随机分为训练集、验证集和测试集;其中,取所述数字化的氨基酸序列的均值作为第一特征值;根据Lb2Cas12a蛋白突变体的氨基酸序列与原始序列的比对,获得突变的位置,取所述数字化的氨基酸序列的突变的位置的数字作为第二特征值; 构建含有超参数的初步数据模型,利用所述训练集、验证集内的数据对所述初步数据模型进行反复训练、验证,获得调整后数据集处理模型;所述调整后数据集处理模型为随机森林回归模型;所述调整后数据集处理模型的超参数为random_state=42,n_estimators=21,max_depth=7,min_samples_split=3,min_samples_leaf=1,其余的超参数设为默认值; 利用所述测试集内的数据对所述调整后数据集处理模型进行测试,获得Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测模型; 根据Lb2Cas12a蛋白的氨基酸个数以及每个氨基酸位置可能突变成20个氨基酸,获得Lb2Cas12a蛋白的单突变体数据集; 使用所述Lb2Cas12a蛋白突变体活性预测模型对所述Lb2Cas12a蛋白的单突变体数据集进行逐条处理,获得Lb2Cas12a蛋白单突变体活性的预测结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人武汉大学,其通讯地址为:430072 湖北省武汉市武昌区珞珈山街道八一路299号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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