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南开大学杜月获国家专利权

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龙图腾网获悉南开大学申请的专利一种基于耗散粒子动力学模拟的细胞骨架建模方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115641917B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-04-21发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211342192.5,技术领域涉及:G16C10/00;该发明授权一种基于耗散粒子动力学模拟的细胞骨架建模方法是由杜月;张帅;成岱;陈逸哲;赵新设计研发完成,并于2022-10-31向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于耗散粒子动力学模拟的细胞骨架建模方法在说明书摘要公布了:本发明提供了一种基于耗散粒子动力学模拟的细胞骨架建模方法,包括以下步骤:步骤1:在耗散粒子动力学模拟软件中设定细胞区域;步骤2:在细胞区域内随机分布、互不交叉的微丝单链;步骤3:在细胞区域内随机生成若干游离的所述交联蛋白粒子;步骤4:所述微丝单链与交联蛋白粒子进行聚合解离,直至三种状态的交联蛋白粒子的数量均趋于稳态,交联蛋白粒子的三种状态分别为游离、只与一条微丝单链结合和与两条微丝单链结合;步骤5:删除交联蛋白粒子,并将同一交联蛋白粒子所连接的两个所述微丝单链直接相连;步骤6:计算细胞骨架参数,输出细胞骨架模型。本发明所构建的细胞骨架具有高保真度,在外力作用下呈现粘弹性等机械特性。

本发明授权一种基于耗散粒子动力学模拟的细胞骨架建模方法在权利要求书中公布了:1.一种基于耗散粒子动力学模拟的细胞骨架建模方法,其特征在于:包括以下步骤: 步骤1:在耗散粒子动力学模拟软件中设定非周期性边界条件,确定细胞区域; 步骤2:在耗散粒子动力学模拟软件中建立骨架微丝,所述骨架微丝为若干在细胞区域内随机分布、互不交叉的微丝单链,所述微丝单链为包含多个微丝蛋白粒子的单链模型,在每条所述微丝单链上随机选择一个微丝蛋白粒子,作为交联蛋白粒子的结合位点; 步骤3:在耗散粒子动力学模拟软件中建立交联蛋白粒子,所述交联蛋白粒子为单个粒子,在细胞区域内随机生成若干游离的所述交联蛋白粒子,每个所述交联蛋白粒子至多与两条所述微丝单链结合; 步骤4:所述微丝单链与交联蛋白粒子进行聚合解离,直至三种状态的交联蛋白粒子的数量均趋于稳态,交联蛋白粒子的三种状态分别为游离、只与一条微丝单链结合和与两条微丝单链结合; 步骤5:删除交联蛋白粒子,并将与两条微丝单链结合的交联蛋白粒子所连接的两个所述微丝单链的结合位点直接相连; 步骤6:计算细胞骨架参数,输出细胞骨架模型; 步骤4中,所述聚合解聚采用基于亲和力的玻尔兹曼分布推导出的成键解离速率表达式,当交联蛋白粒子与微丝蛋白粒子距离足够近的时候,能够以速率形成一个键,如果现有键的长度超过了断裂距离,则以速率断裂,、 ; 其中,为交联蛋白粒子与微丝蛋白粒子的瞬时距离,为初始值,分别为当微丝蛋白粒子和交联蛋白粒子之间的距离为的时候的成键和解离速率,有效开强度和有效关强度分别为在相互作用距离内相应速率的减小和增大程度,为能量单位,为键的弹性系数; 步骤4中,基于动力学速率,使用概率方法筛选在仿真中不合适的键: ; 其中,表示在距离下已形成键的断裂概率,是距离阈值。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人南开大学,其通讯地址为:300000 天津市南开区卫津路94号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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